Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms