Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim8Q99PJ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim8Q99PJ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms