Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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