Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms