Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms