Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Hdac9Q99N13 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Hdac9Q99N13 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac9Q99N13 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac9Q99N13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac9Q99N13 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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