Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkd1Q99MH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms