Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms