Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd2bQ99M03 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms