Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fars2Q99M01 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms