Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms