Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdxdc1Q99K01 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms