Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms