Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdelr1Q99JH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdelr1Q99JH8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms