Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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