Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrif1Q923B3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms