Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms