Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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