Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fam20bQ8VCS3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms