Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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