Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf183Q8QZS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf183Q8QZS5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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