Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms