Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r189Q8K3N3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r189Q8K3N3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms