Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scmh1Q8K214 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scmh1Q8K214 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scmh1Q8K214 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms