Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis1Q8K1M4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms