Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne5Q8JZW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne5Q8JZW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms