Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arhgap29Q8CGF1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap29Q8CGF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms