Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4lQ8CFI0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4lQ8CFI0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms