Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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