Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubqln3Q8C5U9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubqln3Q8C5U9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms