Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms