Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms