Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx16Q8C080 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Snx16Q8C080 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Snx16Q8C080 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx16Q8C080 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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