Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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