Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad3Q8BUN5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad3Q8BUN5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad3Q8BUN5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad3Q8BUN5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad3Q8BUN5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms