Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn7Q8BUM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms