Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rccd1Q8BTU7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rccd1Q8BTU7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms