Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nup54Q8BTS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms