Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rd3Q8BRE0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms