Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc2Q8BKV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms