Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc9Q8BJN4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms