Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbfox3Q8BIF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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