Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Vipas39Q8BGQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vipas39Q8BGQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vipas39Q8BGQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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