Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Amigo1Q80ZD8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amigo1Q80ZD8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms