Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8Q80YR6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms