Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4k2bQ80XI4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4k2bQ80XI4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms