Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms