Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1cQ7TSF0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms