Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec4b1Q7TS58 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms