Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tnfsf18Q7TS55 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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